Bilježnice uvijek morate sigurnosno kopirati, baš kao i ostale datoteke i podatke na računalu. Rušenje tvrdog diska i ljudska pogreška mogu se dogoditi bilo kome, a ako se dogodi vama, vaše bilješke će nestati zauvijek. Ako redovito sigurnosno kopirate bilježnice, možete ih vratiti kad god želite.
OneNote može čuvati ručne, pa čak i automatske sigurnosne kopije svih vaših radnih kopija, ali to trenutno nije moguće u OneNote za web. Detaljne upute o tome kako to učiniti u aplikaciji OneNote 2016 za stolna računala potražite u članku Sigurnosno kopiranje bilježaka i Vraćanje bilježaka iz sigurnosne kopije.